Dem Symposium, an welchem kostenlos teilgenommen werden kann, war ein Wettbewerb vorausgegangen. Im Rahmen dessen waren vier Problemstellungen vorgegeben worden, zu denen Bewerber ihre Lösungsideen mit einer detaillierten Methodenbeschreibung einreichen konnten.

Die biomedizinische Forschung arbeitet unter der Annahme, dass biologische Prozesse in Mäusen oder Ratten solchen im Menschen und analogen Bedingungen entsprechen. Jedoch zeigen z. B. Transkriptomics-Daten auf, dass eine Übertragbarkeit schwierig ist, wenn sie nur auf dem Expressionslevel orthologer Gene, also solcher, die konserviert sind und in den untersuchten Spezies gleichermaßen vorkommen, basiert. Orthologe Gene können sich nämlich in ihrer Funktion unterscheiden und in den Zellen unterschiedliche Rollen spielen.

Zum Beispiel sollten aus Microarrays gewonnene Genexpressionsdaten mit entsprechenden Proteinphosphorylierungen verglichen werden, die nur von der Ratte vorlagen. Von 16 homologen Phosphoproteinen der Ratte sollte dann der Aktivierungsstatus des humanen Phosphoproteins vorhergesagt werden. Ferner sollten Sets an Genen vorhergesagt werden, die Pathways bzw. biologische Prozesse der humanen Zellen repräsentieren. Aus den Phosphoproteinen, Genexpressionen und Cytokindaten sollte auf Netzwerke in den Zellen von Ratten und Mensch geschlossen werden. Da die Systembiologie die Beziehungen und Verbindungen zwischen den einzelnen Komponenten eines komplexen Systems betont, sollte die Konstruktion präziser und vollständiger Pathway-Karten eine der Herausforderungen sein.

Die Ergebnisse des Wettbewerbs werden nun auf dem Symposium vorgestellt. Es gibt zudem eine Preisverleihung und einen Workshop zum Thema Netzwerkverifizierung.

Wettbewerb und Symposium werden von Phillip Morris Products und dem Thomas J. Watson Center von IBM gesponsert.

Weitere Informationen
https://www.sbvimprover.com/challenge-2/sbv-improver-symposium-2013